飘洋过海白酒马英九、萧万长2008就职纪念酒（現南竿廠）成立於1956年3月7日，原名「中興酒廠」隸屬馬祖戰地政務委員會，創立之初，廠址設於復興村（1994年改建為酒廠庫房），租用民舍，設備簡陋，仍循土法釀酒，嗣經積極經營，不斷研究發展創新，1969年擇定復興村208號位置擴建廠房，次年10月10日遷建於現址，更名為「馬祖酒廠」，陸續更新設備，始初具規模，產量逐年遞增。1977年再次擴建廠房，增添設備，加強研究發展，積極吸取釀酒技術，發揮克難創業精神，逐年增產，以應市場所需。

马祖酒廠實業股份有限公司正式成立於1999年8月8日，董事會置董事九人，推選產生董事事長一人，並置監事三人。董事會下設南竿廠、東引廠及台北營業處，其經營型態以公司體制運作，為連江縣所屬的公營事業公司，肩負馬祖地區主要財源收入之重任。

　馬祖酒廠南竿廠前身設址於復興村的「中興酒廠」，成立於1956年，循古法釀酒，早年以生產老酒、高粱酒及藥酒為主，隸屬馬祖戰地政務委員會。1970年擴建廠房於現址，更名為馬祖酒廠，始初具規模，產量逐年遞增。南竿廠以生產大麴、高梁、藥酒和陳年老酒最受歡迎，如今由世華企業公司代理的「八八坑道」系列高粱酒，更是聲名遠播。

　南竿廠窖藏於八八坑道中的馬祖老酒，由於存放時間超過17年，香醇柔順，口感特佳，2008年5月20日，被馬英九總統指定為總統副總統就職國宴酒，經國內各大媒體大幅報導，馬祖陳年老酒頓時聲名大噪，銷量大增

東引酒廠草創於1956年冬，原名「中興酒廠東引分廠」，1961年東引指揮部接管更名為東引酒廠。1979年謝久任指揮官時，斥資新臺幣1200萬元進行擴廠，至1980年7月竣工，始具備現代化酒廠規模。東引廠以釀製高粱酒為主，包括大麴酒、高粱酒及陳年高粱酒，早年曾經生產風濕酒、黃龍酒、百子千歲酒等各式藥酒，近年已停產。

　歷數十年來，東引廠在品質、釀造技術和產量方面，均有突破性進步，尤其以東湧陳高，遠近馳名，不但在陳水扁擔任總統期間被指定為國宴酒，近年來，並已成為馬祖地區最暢銷的白酒，曾經數度供不應求，造成缺貨，由此可見東湧陳高受到歡迎的程度。