紫外线灭菌器的工作原理是根据紫外线波长在240~280nm范围内最具杀破坏细菌病毒中的dna（脱氧核糖核酸）或rna（核糖核酸）的分子结构，造成生长性细胞死亡和（或）再生性细胞死亡，达到杀菌消毒的效果。尤其在波长为253.7时紫外线的杀菌作用最强。